Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ttc39dQ0VF76 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ttc39dQ0VF76 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ttc39dQ0VF76 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ttc39dQ0VF76 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Ttc39dQ0VF76 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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