Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Top2aQ01320 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms