Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms