Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm20743-202ENSMUST00000194322 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Samd15-202ENSMUST00000182869 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Smoc1-203ENSMUST00000129362 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Olfr320-202ENSMUST00000214662 3029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Arpp19-209ENSMUST00000169492 3963 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 B3gat1-205ENSMUST00000161115 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cdc5l-201ENSMUST00000024727 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Cdkl5-201ENSMUST00000087104 3269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Inpp5k-201ENSMUST00000006286 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cbx1P83917 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms