Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vsnl1P62761 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms