Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Itga11P61622 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itga11P61622 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms