Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dpf3P58269 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms