Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CntfP51642 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms