Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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