Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ptx3P48759 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ptx3P48759 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ptx3P48759 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ptx3P48759 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptx3P48759 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms