Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms