Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtprmP28828 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm8091-201ENSMUST00000150506 886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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PtprmP28828 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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PtprmP28828 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtprmP28828 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Cyp2c44-201ENSMUST00000026211 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PtprmP28828 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprmP28828 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprmP28828 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprmP28828 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprmP28828 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PtprmP28828 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PtprmP28828 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PtprmP28828 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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