Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BrafP28028 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BrafP28028 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BrafP28028 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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