Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms