Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ggta1P23336 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ggta1P23336 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ggta1P23336 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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