Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Scd1P13516 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Scd1P13516 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Scd1P13516 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms