Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Vpreb1P13372 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm46404-201ENSMUST00000221461 4114 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms