Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rnf38-201ENSMUST00000045793 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms