Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccl20O89093 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccl20O89093 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Ccl20O89093 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccl20O89093 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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