Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lnx1O70263 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms