Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atf6F6VAN0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atf6F6VAN0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atf6F6VAN0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atf6F6VAN0 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atf6F6VAN0 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms