Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt4B2RU40 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms