Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms