Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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