Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rrp8Q9DB85 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rrp8Q9DB85 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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