Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp12Q9D9M2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms