Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms