Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp1b4Q99ME6 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp1b4Q99ME6 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms