Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc39cQ8VE09 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc39cQ8VE09 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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