Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms