Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms