Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hdac7Q8C2B3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms