Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf428Q8C1M2 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf428Q8C1M2 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf428Q8C1M2 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf428Q8C1M2 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf428Q8C1M2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Znf428Q8C1M2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Znf428Q8C1M2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms