Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.2 ms