Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ClmQ7TSN2 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms