Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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