Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbm27Q5SFM8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbm27Q5SFM8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms