Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
WhammQ571B6 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms