Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Trp53i11Q4QQM4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trp53i11Q4QQM4 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms