Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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