Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
E130208F15RikQ3UPV3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms