Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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