Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms