Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms