Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Dtwd1-202ENSMUST00000170908 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms