Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 n-R5s5-201ENSMUST00000083134 119 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Grin2bQ01097 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2bQ01097 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms