Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Pkn1P70268 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pkn1P70268 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms