Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tra2bP62996 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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