Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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