Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rpl28P41105 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rpl28P41105 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms